流行性感冒（流感）
這是甚麼？流感是由流感病毒引起的傳染病，可以導致輕度流感樣症狀或嚴重威脅生命的肺炎。香港每年有兩個流感季節高峰，期間可能會廣泛傳播病毒。愛滋病毒感染可以使人因流感更容易患上嚴重疾病。
治療：針對流感的抗病毒藥。
醫學預防：建議每年接種一次疫苗。
新冠肺炎
這是甚麼？新冠肺炎是由 SARS-CoV-2病毒引起的呼吸道感染，與 2003 年引起 SARS 的病毒相似。發燒、肺炎和疲倦是常見的症狀。新冠肺炎病毒很容易通過飛沫傳播，也會因與感染者和污染環境的密切接觸而受到感染。部份感染者可能會發展為嚴重疾病，導致死亡。愛滋病毒感染者患嚴重疾病的風險更高。
治療：根據病情和適應症使用抗病毒藥物和類固醇。
預防：強烈建議接種疫苗。
肺炎鏈球菌病
這是甚麼？由肺炎鏈球菌引起的傳染病。 愛滋病毒感染者比較容易患肺炎鏈球菌病，當中最常見的是肺炎，也會影響腦部而導致腦膜炎和引致敗血病。
治療：抗生素。
醫學預防：建議接種疫苗。肺炎鏈球菌疫苗主要分PCV13和PPSV23兩種。未接種過疫苗的人應先注射PCV13然後至少8週後接種PPSV23。
肺囊蟲肺炎
這是甚麼？肺囊蟲肺炎是愛滋病毒感染者首遇最常見的機會性真菌感染，發生時提醒患者免疫力已經出現缺陷。肺炎是常見的症狀。CD4數量經過抗逆轉錄病毒治療後改善，染病的風險隨之降低。
治療：抗微生物藥物治療；可能需要類固醇。
醫學預防：如果CD4數低於200/uL，可使用複方Co-trimoxazole (Septrin）進行預防
結核病
這是甚麼？結核病是香港常見的呼吸道傳染病。愛滋病毒感染者的免疫缺陷，會導致出現非典型結核症狀。由於免疫防禦能力差，較大機會發生再激活疾病。
治療：治療涉及長時間混合使用多種抗生素。
醫學預防：為了防止再激活疾病，潛伏感染者需要接受長達9個月的抗生素療程。潛伏感染一般通過皮膚測試或稱為IGRA的特殊血液測試診斷。